Saken ble tatt til retten av homoaktivisten Gareth Lee, som nå altså har fått medhold.
– Dette er direkte diskriminering som ikke kan forsvares, sa dommeren i sin kjennelse.
Ifølge BBC anerkjente dommeren bakeriets «genuine og dype» religiøse overbevisning, men understrekte at dette ikke hever dem over loven.
LES OGSÅ: Kakekrig kan endre loven
Kaken ble bestilt til den internasjonale dagen mot homofobi i fjor. Den skulle ha påtrykket «støtt likekjønnede ekteskap» og et bilde av barne-TV-figurene Bernt og Erling.
Nord-Irland er den eneste delen av Storbritannia hvor ekteskap mellom folk av samme kjønn er ulovlig.
Førstkommende fredag går naboene i Irland til urnene, og stemmer over et lovforslag om å tillate likekjønnede ekteskap.