De siste månedene har området vært preget av kraftige sammenstøt, og de nye byggeplanene vil neppe bidra til å dempe urolighetene.
– Det er en avgjørelse som kommer til å gjøre mye skade, sier byrådsmedlem Yosef Pepe Alalu, som er imot planene, til AFP.
En talskvinne for det amerikanske utenriksdepartementet sier de er svært bekymret over avgjørelsen.
LES OGSÅ: Jerusalem i brann
Israel tok over området under seksdagerskrigen i 1967 og annekterte det senere, noe som aldri har blitt anerkjent av verdenssamfunnet.
Palestinerne ønsker Øst-Jerusalem som hovedstad i sin egen stat.