Ifølge nyhetsbyrået AP er én FN-ansatt drept og fem andre såret.
Bilder fra byen Deir al-Balah viser tilsynelatende sårede ansatte fra UNMAS, et FN-organ som jobber med minerydding.
AP har også publisert bilder av en tildekket død person som fraktes inn på et sykehus etter en eksplosjon i Deir al-Balah.
Militæret i Israel (IDF) avviser at de har angrepet en FN-bygning i byen.
– IDF hadde ikke operasjonell aktivitet der, og IDF angrep ikke FN-anlegget, sier en israelsk militær talsmann til nyhetsbyrået AFP.
Etter Israels omfattende angrep på Gazastripen natt til tirsdag har det vært nye israelske angrep i området onsdag.
Til sammen er 970 mennesker drept i løpet av to dager, ifølge helsedepartementet i området. Tallet er ikke bekreftet av andre kilder.
Regjeringen i Israel hevder de gjør alt for å unngå sivile dødsfall, men lover samtidig at angrepene vil fortsette.
