Abul Qaqa har flere ganger framstått som talsmann for gruppa, som anklages for en rekke angrep blant annet mot flere kirker i jula.

– Vi gir et tredagers ultimatum til folk fra sør som bor i den nordlige delen av Nigeria om å flytte, sa Qaqa i en telefonkonferanse med flere journalister.

De nordlige delene av Nigeria er hovedsakelig befolket av muslimer, mens det er mest kristne i sør.

Myndighetene har erklært unntakstilstand i flere delstater etter bombeangrepene under julefeiringen, der 49 mennesker ble drept.

Qaqa hevder dette vil føre til at uskyldige muslimer vil bli angrepet av hæren.

– Vi vil konfrontere dem og beskytte våre brødre, sa Qaqa.

Han kritiserte også president Goodluck Jonathan for å ha besøkt en kirke utenfor hovedstaden Abuja lørdag. Det var denne kirken som ble hardest rammet 1. juledag. Hele 44 mennesker ble drept.

Qaqa hevder Jonathan aldri besøkte åstedene for drapene på muslimer i uroen som rammet landet etter valget i april i fjor.

Islamistgruppa Boko Haram antas å bestå av flere ulike fraksjoner med forskjellige mål.